由于生物制藥對攪拌器軸封的無菌性和風險控制提出了更高要求，磁力攪拌器在20世紀80年代在瑞典應運而生。現在，磁力攪拌器成為市場的主流，并繼續朝著簡潔、大扭矩、大剪切力或者極低剪切力、軸承材質安全、易于在線清洗、在線滅菌的方向發展。例如生物反應器專用的下磁力攪拌器、高剪切力均質用下磁力攪拌器等。是否能夠證明攪拌器可以在線清洗和在線滅菌、軸承材質安全等成為生物制藥攪拌器選型前的金標準。

　　臺式磁力攪拌器的工作原理就是利用磁性物質同性相斥的特性，通過不斷變換基座的兩端的極性來推動磁性攪拌棒轉動；缺點是能量轉化效率低，只適合小體積液體攪拌。

　　而工業用磁力攪拌器的工作原理是：由內外兩個磁鋼，中間有隔離套隔開，靠電機驅動后內外磁鋼產生磁耦合達到傳動的目的。磁力泵可以達到無泄漏、并且能量轉化高效。和下磁力攪拌器對應的是上磁力攪拌器，由于仍然沒有去除軸封帶來的風險，應用領域很局限。

　　由于攪拌是一門實驗科學，攪拌器的放大是與工藝過程有關的復雜問題，至今只能通過逐級經驗放大，根據取得的放大依據，外推至工業規模。目前下磁力攪拌器的放大主要依靠制造企業的以常見緩沖液為主要模式溶液的模擬試驗、并在此基礎上做的定型和放大，所有定制型都是在標準型號基礎上的改進，例如材料定制、功率定制、槳葉形狀定制等等。正確選型、選擇合適的攪拌器成為擺在使用者面前的一道必須解決的問題。